מים המכילים מינרלים מומסים מחלחלים דרך הסלע אל תוך המערה ויוצרים תצורות סלע (או ספלאותמים) ברצפה, בתקרה ובקירות המערה. לרוב, ספלאותמים אלו מורכבים מקריסטלים מסוג קלציט (סידן פחמתי) או גבס, אך לעתים הם גם מכילים מינרלים אחרים אשר מוסיפים להם צבע. בין הספלאותמים הנפוצים ניתן למצוא נטיפים, זקיפים, גבישים בצורת ׳שיערות׳ או ׳ספגטי׳, פנינים, עמודים ועוד. ספלאותמים נוצרים באיטיות, לעתים במשך אלפי שנים. חלקם הפסיקו לגדול בגלל שינויים במזג האויר או שינויים בזרימה של המים בתוך המערה.